fbpx

חברת Nvidia מעניקה גישה חופשית ל-Parabricks למדענים החוקרים את נגיף הקורונה

כשמשבר פוגע, כולנו מתמודדים עם כל מה שיש לנו. בתגובה למגיפת הקורונה שמתפשטת במהרה בשבועות האחרונים, Nvidia משתפת כלים חדשניים לחוקרים המסוגלים להאיץ את המחקרים שלהם העוסקים בכל הקשור להבנת וירוס הקורונה החדש ופיתוח חיסונים נגדו.

ניתוח מידע גנטי מכל סוג הוא משימה חישובית אינטנסיבית במיוחד, מדובר במשימות שעלולות לקחת שבועות ארוכים ואפילו חודשים. מדובר בזמן ארוך במיוחד ויקר במיוחד, בעיקר כאשר אנחנו נמצאים בעיצומה של התפרצות של מגיפה. על מנת להאיץ את המחקרים השונים העוסקים בנגיף הקורונה, תספק Nvidia רישיון חינם ל-90 ימים לפלטפורמת Parabricks לכלל החוקרים בעולם העוסקים במלחמה בוירוס הקורונה.

בהתבסס על ה-Genome Analysis Toolkit ועל כרטיסי מסך (GPUs), פלטפורמת Parabricks עשויה להוות כלי מרכזי וחשוב במיוחד במלחמה בנגיף הקורונה. השילוב שבין Genome Analysis Toolkit לכרטיסי המסך של Nvidia מסוגל להאיץ את ניתוח רצפי ה-DNA עד לפי 50 מהר יותר ביחס לשימוש בכלים "רגילים" אחרים.

"אנו מודעים לכך שהמגפה הזו מתפתחת ולכן אנחנו עוקבים אחר המצב ונרחיב את ההצעות שלנו ככל שיידרש ועל פי הצורך. במידה ואתם מדענים בעלי גישה לכרטיסי המסך של Nvidia, מלאו את הטופס כאן להגשת בקשה לרישיון ל-Parabricks." כך נמסר מחברת Nvidia.

לחוקרים העובדים עם Oxford Nanopore long-read data, סט כלים המואצים על ידי כרטיסי מסך זמין דרך אתר Github כאן. בנוסף לכך, יישומים רבים כדוגמת MedakaRaconRavenReticulatus ו- Unicycler מגיעים עם האפשרות להאצה על גבי כרטיסי המסך של Nvidia.

מדענים חוקרים כיום את נגיף הקורונה החדש ויחד עם זאת גם את האנשים שנדבקו במחלה במטרה להבין, בין היתר, מי הן קבוצות האוכלוסיה המושפעות יותר מאחרות. יחד עם זאת, ניתוח רצפים גנומיים לוקח זמן רב וכוחות מחשוב רבים. האצת המדע היא מזמן חלק חשוב מהמשימות של Nvidia . צוות Parabricks הצטרף ל-Nvidia בדצמבר, וסיפק את הכלי החדש ביותר ביותר עבור משימה זו. השימוש ב-Parabricks מסוגל לצמצם את זמני החישוב הדרושים מימים ארוכים לפחות משעה על גבי שרת בודד לפי Nvidia.

בהתחשב בהתפשטות חסרת התקדים של הנגיף, קבלת תוצאות בשעות לעומת ימים עשויה להשפיע בצורה חסרת תקדים על הבנת התפתחות הנגיף והתפתחות חיסונים. Nvidia מזמינה את השותפים הרבים שלה להצטרף אליה למאמץ המשותף והדחוף לסייע לקהילת המחקר בכל רחבי העולם. בנוסף לכך, בימים אלו ממש Nvidia מנהלת דיונים עם ספקי שירותי ענן ומרכזי מחשב-על בכדי לספק משאבים וגישה ל-Parabricks בפלטפורמות שלהם.

טוני מלינקוביץ'
טוני הוא העורך הראשי שלנו כאן באתר, עם ידע רחב בחומרה ומקורות מהירים, טוני הוא גם הכתב המהיר ביותר שלנו, בנוסף לכתבות המעולות של טוני הוא גם אחראי על רוב הביקורות שלנו באתר וגם על המלל וחוות הדעת על חלק מסיקורי הוידאו שלנו.
דילוג לתוכן